区别是：摩根士丹利开始是投行后来成为了银行控股公司，摩根大通一直都是商业银行，但旗下有投行业务，摩根士丹利原来是摩根大通的投资部门，后因金融危机独立出了摩根大通。

摩根大通集团由J．P．摩根公司和大通-曼哈顿公司合并而成，是美国主要的商业银行，业界称西摩或小摩。摩根士丹利则是称呼为“大摩”。