方法一：微创治疗(内镜)。符合内镜下治疗指征的息肉可行内镜下切除，并将切除标本送病理检查。

方法二：手术治疗。息肉有恶变倾向或不符合内镜下治疗指征，或内镜切除后病理发现有残留病变或癌变。

方法三：药物治疗。(1)对症治疗，采用此法时，可以先对肠息肉患者进行止血操作，然后再针对其在患上该病后出血量的多少，进行相应的处置。(2)病因治疗，溃疡性结肠炎导致的炎性息肉参见溃疡性结肠炎的治疗。(3)预防治疗，家族性腺瘤性息肉病(FAP)患者可服用塞来昔布减少腺瘤性结直肠息肉数目，每日两次，与食物同服。