原因一、神经内分泌功能失调引起：主要是下后脑－垂体－卵巢轴的功能不稳定或是有缺陷，即月经病。

原因二、器质病变或药物等引起：包括生殖器官局部的炎症、肿瘤及发育异常、营养不良；颅内疾患；其他内分泌功能失调如甲状腺、肾上腺皮持功能异常、糖尿病、席汉氏病等；肝脏疾患；血液疾患等。

原因三、使用治疗精神病的药物；内分泌制剂或采取宫内节育器避孕者均可能发生月经不调。也有部分从事运动职业的女性或是有了妊娠反应的情况后也会有这样的情况。