办理进出口退税资格认定变更，需提前整理好税务机关要求报送的相关资料，下载安装出口退税申报系统，在系统中进行申报。在申报系统中选择系统维护、系统配置、统配置设置与修改，配置出口企业相关信息。通过菜单中基础数据采集、资格认定相关申请录入、退（免）税认定申请录入，录入企业退（免）税资格认定相关内容。