营改增后异地工程交税应当持税务登记证副本和所在地税务机关填开的外出经营活动税收管理证明，向营业地税务机关报验登记，接受税务管理后回所在地缴税；对于未在异地设立分支机构的,施工企业采用由机构所在地开具《外出经营活动税收管理证明》，经工程所在地税务机关进行报验登记后，按照营业税暂行条例规定的时间确认收入，由工程所在地税务机关开具工程款发票并申报缴纳营业税等相关税费。