第一：一些对抗生素比较敏感的细菌被杀灭，而相对不怕这些抗生素的霉菌却乘机大量生长。由于霉菌大都会产生各种颜色，因而就可在舌头上出现从棕色到黑色的各种苔色，停用抗生素后可以自然恢复。

第二：然而也有人并没有用过抗生素而出现黑苔。例如有些长期发热的人，可出现焦黑苔，中医认为是热极化火，火把舌苔“烤焦”了而形成黑苔。有一些慢性病，例如尿毒症、恶性肿瘤等，在病情恶化时也会出现黑苔，这是病情危急的征象。

第三：还有一种情况，当精神处于高度紧张的状态时，也会出现黑苔。例如，怀疑自己患癌的“恐癌症”病人，有的没有几天舌苔就黑了，舌根部苔很厚甚至像毛发那样由后向前倾倒，等到检查后排除了癌肿，思想顾虑解除了，常可以无药而愈，黑苔自然消失。有人解释，在精神紧张时，口腔内酸度增加，有利于霉菌的生长。