根据灰指甲的病症成都不同，可以分为局部性和系统性治疗两种治疗方法，无论使用哪种方法，都应该坚持全面和持久的治疗观点。

治疗方法一，局部性治疗：适合于病甲数量少的患者，可以使用坚持外涂5%阿莫罗芬指甲油、8%环吡酮氨（环己毗酮氨乙醇）指甲涂剂30%醋酸、乳酸碘配液(10%碘配和乳酸各50%混匀)或复方水杨酸软膏。

治疗方法二，系统性治疗：适合于局部性治疗无效者或是病甲数量过多者，使用，特比萘芬：对皮肤癣菌和真菌感染有效。伊曲康唑：对皮肤癣菌、酵母菌和真菌感染均有效。氟康唑：对皮肤癣菌、酵母菌和真菌感染均有效。外用和内服相结合，基本上可以达到治疗的目的。