上海海关的隶属海关包括：浦东海关， 浦东国际机场海关，吴淞（宝山）海关 ， 浦江（龙吴）海关，外港海关， 洋山海关， 外高桥保税区海关 ，经济技术开发区海关， 奉贤海关，莘庄海关 ，嘉定海关 ，金山海关 ， 青浦海关和松江海关。

上海海关是国家设在上海口岸的进出境监督管理机关，是中华人民共和国直属海关。主要任务是：按照《中华人民共和国海关法》和其他有关法律、法规，监管经上海口岸进出境的运输工具、货物、行李物品、邮递物品和其他物品，征收关税和其他税费，查缉走私并编制海关统计和办理其他海关业务。