U盘格式化后存在文件的原因和删除方法如下：

原因：U盘损坏。

删除方法：

1、在系统中打开电脑资源管理器，选中U盘。点击鼠标右键，在菜单中选择“属性”选项。

2、在属性窗口中请点击顶部的“工具”栏目，随后在工具选项卡中点击“开始检查”按钮。

3、点击“开始”按钮，对U盘进行文件系统修复。

4、当文件系统修复完成以后，之前删除过的文件会从U盘上消失，并恢复文件所占用的空间验判。