1、明朝开国皇帝朱元璋，安徽凤阳人，做过和尚、当过乞丐，参加农民起义，最后打下大明江上的时候定都南京即金陵，也死在南京，所以陵墓建在南京。2、第二位皇帝朱允文即建文帝因其叔父朱棣以为皇帝解除危难为名发兵打到南京，建文帝不知所终，有人说出家当了和尚，下落不明，这在明朝历史上是一个悬案，所以没有陵墓。3、第七位皇帝朱祁钰，因其兄英宗皇帝被瓦剌所俘，在太后和大臣的旨意下即了帝位。后英宗被放回，在心腹党羽的策划下，发动了一场“夺门之变”，英宗复辟，坐回了皇帝。朱祁钰被害死，英宗不承认他是皇帝，将其在天寿山区域内修建的陵墓也给捣毁，以“王”的身份将他葬于北京西郊玉泉山。

所以，明朝十六帝有两位葬在别处，一位下落不明，其余十三位都葬在天寿山，所以称“明十三陵”。