现在的黑龙江省并不是原来的黑龙江辖区行政辖地，原来的黑龙江辖区管辖黑龙江流域中上游和外兴安岭西部，现在的黑龙江省只管辖黑龙江南岸和原来吉林的南部部分地区，现在的黑龙江省是1954年才形成的。

清朝统一全国前，已经加强了对东北地区的统治，设盛京总管统辖。为抵御沙皇俄罗斯势力对黑龙江流域的入侵，1652年，清廷派兵驻守，宁古塔、盛京两昂邦章京并存，东北地区被划分为两大军事驻防区域，也即两个行政区域：在中国清朝时期黑龙江流域部分属黑龙江将军辖区，流域部分属吉林将军辖区。

今黑龙江地区大部分位于宁古塔将军辖区（吉林将军辖区）之内。1683年12月，清廷决定，划出宁古塔将军（吉林将军）所辖之西北地区，增设镇守黑龙江等处地方将军，简称黑龙江将军，管辖黑龙江将军辖区。形成盛京、宁古塔、黑龙江三将军共同守卫东北。这是黑龙江成一个军事、行政区域并以“黑龙江”命名的开端。