发酵豆制品有腐乳、豆豉、豆酱和酱油等食品，豆制品发酵微生物是指参与豆类发酵制成食品的微生物。中国早在4000年以前就有用豆类酿制食品的记载。在马王堆一号汉墓出土的葬品中(2000年前)已有豆酱和豆豉。北魏时期编纂的《齐民要术》比较全面地介绍了利用微生物制造豆类食品的方法。