左侧的河道是灌溉总渠，右侧河道是入海水道，中间的立交上走的是京杭大运河，与入海水道立交，与总渠交汇。两条河流均起于洪泽湖，总渠主要灌溉，以淡水为主；入海水道主要泄洪，另一功能则是排放污水。

总渠因为常年灌溉，水位较为稳定，因此在控制时与横穿而过的大运河交汇，而入海水道因为泄洪与平时水位差距较大，设计为立体交叉，建设立交涵洞，上行大运河，下行入海水道，互不干扰。此水上立交工程亚洲最大。