湄洲妈祖祖庙坐落在妈祖信俗遗产地莆田市湄洲岛，湄洲岛因形似娥眉而得名，面积14多平方公里。

妈祖是流传于中国沿海地区的民间信仰，是历代航海船工、海员、旅客、商人和渔民共同信奉的神祇，民间在海上航行要先在船舶启航前要先祭妈祖，祈求保佑顺风和安全，在船舶上立妈祖神位供奉。

明清海禁，泉州港衰落，大批民众为了生计下南洋过台湾，妈祖信仰也随着商人和移民的足迹更为广泛地传播。