内部审计主要审查公司内部的经营管理、风险控制能力、内部治理情况等，如公司内部的采购流程、生产流程、销售流程、人事部绩效管理、财务管理、物流管理等，以及进行舞弊调查，接受举报投诉。内部审计会对公司某一部门的工作效率和效益进行分析，访谈部门的相关人员，对财务数据进行测试，然后发现公司管理过程中存在的问题，对业务员的销售订单进行检查，测试订单的真实性情况，挖掘销售部门的市场管理过程中存在的问题。内部审计是公司独立的部门，直接对公司董事会负责，由总裁或副总裁直接管理；大部分内部审计部门都可以针对审计发现的问题对被审计单位的管理人员和违规责任人提出处罚建议，甚至直接做出处罚决定，遇到重大经济案件会和公司的法务部门进行联合稽查，提交当地公安机关处理。