电子口岸卡有操作员卡和法人卡两张。

最为常用的操作员卡，操作员卡是用来申请核销单、办理核销申报、申请结汇额度、提交报关数据等的平台钥匙，每个进出口企业都需要申请。

法人卡又称公章卡，是指在中国电子口岸中唯一代表企业身份的IC卡。该卡由企业的法定代表人或其指定的人员持有，企业可以为本企业人员申领操作员卡，并对本企业的操作员卡进行停用、注销等管理，并可以法人名义对本企业的电子文件进行数字签名。