1、保险公司不同。根据产品资料显示，好医保长期医疗是由中国人保健康提供，而好医保住院医疗则是由众安保险承保。所以两者之间的第一个区别就是保险公司不同，当然这两家公司都是合法的正规保险公司，因而影响并不大。

2、最高保额不同。好医保长期医疗的一般疾病及意外医疗保险金为200万，100种重大疾病医疗保险金为400万。而好医保住院医疗的一般疾病及意外医疗保险金为300万，100种重大疾病医疗保险金为600万。但我们不能仅仅从保额的最大值来比较谁优谁劣，实际上所谓的200万和300万噱头成分更重一些，还是要比较一下保险条款的具体内容。

3、免赔额不同。好医保长期医疗的免赔额为每6年累计1万元，而好医保住院医疗的免赔额是每年1万元。譬如某人2018年住院自费8000元，2019年住院自费8000元，这种情况好医保住院医疗是不进行赔付的，而好医保长期医疗则会赔付6000元。其实这一点是很重要的，因为许多保险都是因为不符合赔付条件或者没达到赔付条件而被人诟病，相比较来说，好医保长期医疗要更良心一些。