起诉离婚协议离婚的区别是：

1、时间不同，起诉离婚一审简易程序审限3个月，普通程序6个月，协议离婚只要双方有关的材料齐全，最快的几分钟即可完成离婚手续；

2、费用不同，起诉离婚案件每件交纳50元至300元，协议离婚只需要缴纳工本费9元钱；

3、程序不同，起诉离婚要经过审查、受理、送达、举证、开庭等程序，而协议离婚则没有。

【法律依据】

根据《婚姻法》第三十一条，男女双方自愿离婚的，准予离婚。双方必须到婚姻登记机关申请离婚。婚姻登记机关查明双方确实是自愿并对子女和财产问题已有适当处理时，发给离婚证。