首先是证件名称不同，房产证全名为中华人民共和国房屋所有权证，不动产权证书全名为中华人民共和国不动产权证书。其次是监制机关不同，房产证受住房和城乡建设部监制，不动产权证书受国土资源部监制。最后权证编号不同，房产证的编号为建房注册号和房屋所有权证号，不动产权证书的编号为证书编号和不动产权编号。