干湿分离卫生间的缺点主要有：局限性大，要求卫生间有较大面积，会使使用者的习惯受到干扰，费用较高。1、局限性大并不是所有的户型都适合干湿分离的，一般只有面积比较大的新房适合。即使旧房子可以做，也需要后期的改造。2、面积要大。干湿分离对面积有比较大的要求，卫生间加外面的洗浴台面积小容易导致拥挤。3、习惯不同。有些人喜欢上完厕所之后就直接的洗手，如果是干湿分离，就要走在外面再洗手，会有不习惯。4、费用较高。因为不是任何户型都适合，一般只适合现在的新房且面积较大。即使有些旧房子是可以改造，但工程就比较麻烦，花费自然要高。