这两者在供应对象、建设方式、土地取得方式、政策优惠、定价方式、买卖要求以及产权性质上均有所不同。具体如下：1、城市中低收入的家庭或者住房困难户是保障性住房的主要供应对象，而商品房的供应是面向所有自然人的。2、保障性住房面积偏小但都是由政府直接组织建设的，而商品房户型多种多样，面积也大小不等，是完全按照市场运作方式进行建设的。3、保障性住房的土地取得必须得是政府划拨才能进行建造，而商品房建造所需的土地及土地使用权，是通过招拍挂的方式取得的。4、保障性住房不论是在建设还是在销售的过程中，费用方面政府都会给予适当的减免，而商品房没有这种优惠，需要全额缴纳所有的费用。5、保障性住房是由政府定的房价，然后出售，而商品房的价格主要受市场规律的影响，每个时期都不太一样，需要试具体情况而定。大多数情况下商品房的价格都是高于保障性住房的。6、如果是商品房，那在办理了《房屋所有权证》以后就可以进行抵押和转让。但如果是保障性住房，虽然可以办理《房屋所有权证》也可以进行抵押，但如果您要转让，那就必须补缴相关的费用，并在满足了一定年限以后，才可以进行转让。7、如果您是商品房的购买人，那您拥有完全产权，可以自由处分您的房屋，但如果您是保障性住房中的廉租房那就只能居住，也就是您只有使用权，不能随意对房屋进行处分，其中经适房是不完全产权，这种房子在5年内是不得进行买卖的。