1、原材料不同。芋圆的原材料是香芋、红薯、紫薯、木薯淀粉等等，具有多个种类；珍珠的原材料是木薯淀粉。

2、颜色不同。芋圆是由香芋蒸熟后碾压成泥，之后加上红薯粉、紫薯粉或木薯淀粉蒸熟制成的，所以其颜色非常丰富；而珍珠一般为黑色。

3、形状不同。芋圆的形状比珍珠要大，一般为圆柱状或者方块状；珍珠的形状相对较小，质地更为柔软，一般为圆球状。