1、改善心血管疾病。血浆胆固醇含量高是导致心脏病的主要原因。饮食中动物脂肪可以提高血浆胆固醇含量，是导致动脉硬化、诱发心脏病的重要因素。南瓜籽蛋白中不含有胆固醇，可以代替动物蛋白。

2、提高机体免疫力。南瓜籽蛋白可以促进免疫球蛋白的合成，有效增强体液免疫;还可提高T淋巴细胞增殖，增强细胞免疫应答;还可通过促进多种内分泌激素的释放，包括胰岛素、生长激素、催乳素、抗利尿激素、和儿茶酚胺等，达到调节免疫的作用。

3、促进肌肉合成。南瓜籽蛋白与普通植物蛋白不同，它含有大量的谷氨酸。谷氨酸在人体中首先合成谷氨酰胺。实验研究证明，谷氨酰胺能够增加肌肉细胞体积、刺激肌肉蛋白合成，提高肌肉活力，使肌肉得到增长。目前市场多用乳清蛋白作为增肌粉原料，但是乳清蛋白是动物源蛋白素食主义者不宜食用，且乳清蛋白中含有乳质过敏源，而南瓜籽蛋白为植物蛋白，不含任何过敏源，易过敏体质者完全可以安心食用。

4、抗氧化。酶解南瓜籽蛋白得到酶解液，测DPPH清除率为83.47%，所以水解南瓜籽蛋白具有抗氧化作用。

5、糖尿病。南瓜多糖、分子量大于 60 ku和分子量小于 3 ku的蛋白组分 ,可以显著提高糖尿病大鼠胰岛素水平，3～ 60 ku的蛋白质组分的降血糖效果最佳 ,不但可以显著降低糖尿病大鼠空腹血糖值 ,而且可以改善各时段的糖耐量 。