区别一：两者最明显的区别其实就是药材的区别。两味药中就差了知母和黄柏，主要是加大了滋阴，去湿热之功效，如果是一般的肾阴虚的话，六味地黄丸就可以达到效果了，不用吃知柏地黄丸。

区别二：其实知柏地黄丸就是六味地黄丸基础上制成的，知柏地黄丸在六味地黄丸基础上加入知母、黄柏而成，知柏地黄丸除了有六味地黄丸的效果之外，还有降火的效果。

区别三：两者的区别还表现在药物的功效上。 知柏地黄丸在滋阴补肾的基础上，增加清虚热的作用，用于阴虚火旺，潮热盗汗，口干咽痛，耳鸣遗精，小便短赤等，六味地黄丸的作用就是滋阴补肾。用于肾阴亏损，头晕耳鸣，腰膝酸软，骨蒸潮热，盗汗遗精，所以肾阴不足用六味地黄丸，在肾阴不足的基础上还有虚热表现的用知柏地黄丸。