原因一：高密度脂蛋白胆固醇密度的降低，说明患心血管疾病的几率会增高，要需要根据总胆固醇和低密度的情况来决定。

原因二：营养不是很充足，也会导致高密度脂蛋白胆固醇密度降低，本身高密度脂蛋白越高越好，但是胆固醇偏低，可以见于营养不是很好，原因有生理性也有病理性的。

原因三：脑血管病，常见于先天性脑部发育异常，冠心病等引起脑部后天发育不良，从而导致高密度脂蛋白胆固醇密度降低。