人民法院不能办理协议离婚，只能办理诉讼离婚。

协议离婚程序如下：

1、双方到一方户口所在地的婚姻登记管理机关申请离婚登记。

2、婚姻登记机关对双方是否存在合法婚姻关系、财产分割、子女法院等问题进行审查。

3、审查后符合离婚调解的发放离婚证。