用户申请了两个ETC是没有什么影响的，但两个中，用户只可以激活其中的一个。一个激活成功，另一个激活的时候就会提示车牌被占用，因为一个车牌只可以绑定一个ETC。而两个ETC都没有激活的话，两者是不起冲突的。

也有部分ETC，即使没有激活也会有相应的记录，那么这时候就不可以申请第二个。