菜枯发酵用来肥水的发酵方法，菜枯是蛋白原料，里面含氮比较高，是作为水肥的优质原料，但菜枯中的蛋白是高分子状态，不能直接施于水中，不然的话，会造成水体短期内缺氧，因为大分子的蛋白施于水中后，会消耗水中的氧气来分解它，最终成为氨基酸和小肽后，才最容易被藻类利用和水生动物利用，但在分解成氨基酸和小肽之前，会消耗大量水体中的溶解氧，所以，必须最好在岸上预先把菜枯发酵分解后，再作为水肥。