申请仲裁员回避的程序：

1、回避申请的提出时间。仲裁员自行回避的提出时间，法律无明文规定。但对当事人申请仲裁员回避的时间是有时间限制的，当事人未在规定期间内提出回避申请，则其申请回避的权利即归于消灭。

2、回避决定的作出。无论是仲裁员自行提出回避，还是当事人依法提出回避申请，仲裁员是否回避，都要由特定的机构或特定的人员对回避事由进行审查，并作出是否准许回避的决定。

3、当事人的举证责任。当事人申请回避时应当说明事实和理由并提供证据，即所谓“谁主张、谁举证”，以便仲裁机构进行审查，作出仲裁员是否回避的决定，同时也防止当事人滥用回避申请权，拖延仲裁程序。