新疆昌吉卫生学校开设有护理、药剂、口腔工艺技术等15个专业，设有护理、药学、三理、解剖、生物与微生物、临床等13个教研组，建立了解剖、病理、中草药等标本室和基础护理、临床护理、药剂、临床检验等45个实验实训室。截至2010年9月，新疆昌吉卫生学校为社会培养了2万余名毕业生，学校先后荣获全国十佳办学单位、中国校园文化建设百佳示范学校、全国教育网络系统示范单位。《中国教育报》、《人民日报》、《昌吉日报》等媒体多次报道了该校特色办学情况。