酶作为一种生物催化剂，已广泛地应用于轻工业的各个生产领域。近几十年来，随着酶工程不断的技术性突破，在工业、农业、医药卫生、能源开发及环境工程等方面的应用越来越广泛。

酶工程，又可以说是蛋白质工程学，是利用传统突变技术或是分子生物学技术，将蛋白质上的氨基酸进行突变，以改变蛋白质之化学性质和功能。例如：在酵素的应用上，可以让原本不耐热的酵素，经过酵素工程改变后，成为耐热的酵素。