中制药工程专业较好的三本大学有：

1、辽宁中医药大学杏林学院：成立于2001年7月，2004年3月被国家教育部批准辽宁中医学院杏林学院全日制本科高校。设有中医学、中西医临床医学、中药学、制药工程、护理学、针灸推拿学等10个专业或专业方向。

2、湖南中医药大学湘杏学院：位于湖南省长沙市，是经国家教育部和湖南省人民政府批准成立国家承认学历的全日制本科独立学院，湘杏学院的主办单位湖南中医药大学，是一所以教学为主体，科研、医疗、校办产业综合发展的高等中医药学府。

3、武汉生物工程学院：位于湖北省武汉市，是中国第一所生物工程类普通本科高等院校，同时也是湖北省第一所获得学士学位授予权、顺利通过国家教育部本科教学工作合格评估的民办高校。