理论上来说是不可以的，过滤网只是一种简单的物理过滤作用，清楚大于一定大小的固体物质，而蛋白分离器不是过滤器，而是一台简单的机器，蛋白分离器能增加水中的溶氧量，而过滤网不行。

蛋白分离器会氧化水中的微量元素，从而导致盐分的丧失，另外，如果是淡化海水的话，海水被雾化后会无孔不入，且腐蚀性很强，同时，水中也含有一些蛋白质分离器所不能分解的物质，包括血浆蛋白之类的蛋白质，以及氨基酸中蛋白素的某些成分。

通常蛋白质分离器只能清除30%到50%的物质，若要蛋白质分离器愈活跃，它所需要的动力就愈多，而过滤网的效果只与水里不溶性颗粒的大小有关。