万寿菊和孔雀草的株型不同，万寿菊较高，而孔雀草较矮；两者花形相似，但前者的花朵更大，直径更长，孔雀草瓣上有红色斑块。孔雀草的花期在每年7-9月份，万寿菊的花期长，在6-10月。

孔雀草的植株较矮，高30～100厘米，万寿菊的植株较高，高60～100厘米，从株型上看，万寿菊的更高一些。

万寿菊和孔雀草开的花是极为相似的，但是二者有着一些明显的不同，万寿菊的花朵更大一些，花朵直径约6-8厘米，而孔雀草花朵相对较小，花朵直径约3-5厘米。