飞行时间质谱技术是将样品经过简单的预处理后直接滴加到表面经过特殊修饰的芯片上，既可比较两个样品之间的差异蛋白，也可获得样品的蛋白质总览。

飞行时间质谱技术在应用方面具有显著优势。技术分析的样品不需用液相色谱或气相色谱预先纯化，因此可用于分析复杂的生物样品。