1、含义不同

泯灭

（形迹、印象等）消灭。

湮灭

湮没。

2、出处不同

泯灭

鲁迅 《且介亭杂文二集·“题未定”草五》：“我以为介绍别人的作品，删节实在是极可惜的，倘有妙文，大家都应该设法流传，万不可听其泯灭。”

湮灭

师陀 《期待》：“他死了好几年，从人世上湮灭好几年，还一年一年被等待，被想念。”

3、指代不同

泯灭

指精神层面，比如泯灭人性，因此泯灭特指理念层次上的消亡。

湮灭

指物理意义，例如物质湮灭，因此湮灭含物理意义上的毁灭。