果胶酶主要是分解果胶，果胶的存在易导致果汁出汁率低，果汁浑浊。果胶酶的作用表现在以下两个方面：

1、瓦解植物的细胞壁及胞间层，使榨取果汁更容易；

2、把果胶分解为可溶性的半乳糖醛酸，使浑浊的果汁变得澄清，因此可以解决果汁加工中出现的问题。