运行速度不同：G字头高铁时速，300-350km/h。D字头动车时速，200-250km/h。

运行轨道不同：高铁对轨道要求高，轨道一般采用无砟轨道，无砟轨道是指采用混凝土、沥青混合料等整体基础取代散粒碎石道床的轨道结构，又称作无碴轨道，是当今世界先进的轨道技术。而且高铁线路一般采用100m轨道，轨道连接处需要进行焊接和打磨，处理成很平顺的轨道，所以高铁基本在新建的铁路上运行。动车既可以在有砟轨道上运行，也可以在新建高铁的无砟轨道上运行。

车次标识不同：G字头的车次是高铁，D字头的车次是动车，而且一般高铁的票价比动车贵。

车型不同：高铁使用车型CRH2C、CRH3、CRH380系列动车组，动车使用车型CRH1、CRH2、CRH3、CRH5系列动车组