1、表皮颜色。青柠檬：从挂果到成熟都是青色。黄柠檬：会随果实不断成熟慢慢变黄。

2、外观、果肉颜色区别。青柠檬：外皮颜色碧绿，表面光滑似橘，肉色通秀。黄柠檬：表面纹理粗糙，淡黄色的肉色。

3、维生素C含量。营养成分上基本相同，但青柠檬的维生素C含量要比黄柠檬高一些。

4、口感青柠檬闻起来有股淡淡的柠檬香，且维C含量，吃起来会比黄柠檬更酸一些尤其是进口小青柠成熟后味道极酸；国产青柠成熟后酸味不重、回味捎带苦涩。黄柠檬散发着一股浓郁清香，果肉色泽浅金淡黄，口感酸、薄。

5、价格。青柠檬要比黄柠檬的价格贵一些。

6、用途。青柠檬：果汁比黄柠檬多一点，更适合榨汁或制作成酸味浓郁的果汁饮料，也常当调料和鱼肉一起烹饪去腥。黄柠檬：多用于西餐、欧陆的料理，柠檬汁（配海鲜去腥），也用于榨汁泡柠檬水，也可以适应着当水果吃。