鱼的发光器一般有两种，一种是鱼的皮肤里的能发光的细胞，会分泌一种含磷的粘液，磷和血液中的氧接触就发出光来，有些鱼的发光器构造比较复杂。灯笼鱼在头部的前边、眼的附近、身体侧线下方和尾柄上，有排列成行或成群的圆形发光器，当然，不同种类的灯笼鱼，它的发光器的数目和排列位置也不同，有的灯笼鱼尾部有一个发光的追逐器，很像汽车的尾灯；有的头部还有一个特大的发光球，很像中国古代的灯笼。它的发光细胞的外面围着反光的细胞和色素细胞层发光器的上面和探照灯的结构差不多，有透镜状的结构，所以能发出比较亮的光。

另一种发光器是它的里面有发光的细菌。例如光睑鲷的发光器在眼睛的下方口里面有几亿个发光细菌，这些细菌把从鱼的血液中得到的能量变为荧光。光睑鲷的发光本领胜过任何生物，在夜间人们大约从15公尺远的地方就能看到它发出的光亮。