交换率指重组配子数、个体数占总配子数个体数的百分率。 影响基因交换率的大小因素主要有：两个非等位的连锁基因在染色体上距离。交换率与两基因的距离成正比，两基因距离愈近，染色体片段发生互换的可能性愈小，杂交后代重组数量愈小；反之，两基因距离愈远，染色体片段发生互换的可能性愈大，杂交后代重组数量愈多。重组率大小在0z至百分之50之间。