1、程序所属的类型不同，了解内部控制属于风险评估程序，控制测试属于进一步审计程序；

2、目的不同，了解的目的是评价控制的设计，确定控制是否执行，控制测试的目的是评价控制的执行效果；

3、程序有所不同，穿行测试主要用于了解内部控制，重新执行主要用于控制测试；

4、必要性不同，了解内部控制是必要程序，控制测试不是必要程序；

5、程序的范围不同，在了解控制是否得到执行时，只需抽取少量交易检查或观察某几个时点。测试控制运行的有效性时，需要抽取足够数量的交易检查或对多个不同时点观察。