联系：基因组控制蛋白质组的聚合。

区别：基因是遗传物质.蛋白质组是基因组的表现形式。

基因组，一般的定义是单倍体细胞中的全套染色体为一个基因组，或是单倍体细胞中的全部基因为一个基因组。

蛋白质组的概念最先由MarcWilkins提出，指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。

蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。