三方协议不影响事业编，三方协议只是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，能解决应届毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题。协议在毕业生到单位报到、用人单位正式接收后自行终止。公务员、事业单位考试中没有相关对三方协议有要求的，签订三方协议后不会影响你以后公务员、事业单位的考试和工作。