长时间放置食物滋生细菌。焖烧杯中适宜的温度和湿度容易引起细菌滋生，从而引起胃肠道功能失调，不建议食物，尤其是熟食长时间放置。所以使用焖烧杯烹饪的食物不建议长时间放置，尽早吃掉噢，以免引起疾病。

不能保证将食物煮熟、热力学定律告诉我们这个世界的能量是守恒的，而且热量只能自发的从高温物体传到低温物体。在这个杯子上的呈现就是，即便不考虑不能避免的散热问题，将食物煮熟的能量也只能来自于你倒进来的热水。因为没有外部热源，而且随着食材温度升高，热水温度降低，两者最后达到温度相同。这个温度也就是食材理论上能达到的最高的温度，根据你放的食材的种类和量会有比较大的差别，也和你的水温有关。粗糙算了一下，如果用来焖饭的话，加入米和95度左右的开水(一般开水的温度)，不考虑散热，最终也就能达到65度左右。如果你之前忘了预处理用热水烫杯子，温度则会更低。那65度的温度够把饭菜做熟么？很难说，因为熟是一种情怀，不是量化标准。人类吃熟食的目的有几种，除了味道好以外，还要杀灭有害细菌病毒和寄生虫，以及将食物处理成我们退化了几十万年的消化系统可以处理的半成品。从消毒杀虫的角度来看，65度属于比较尴尬状态。大部分的细菌、病毒和寄生虫卵在这个温度不能长期生存，但也只是大部分而已。一般来说消毒要求的温度应该在70甚至80度以上，虽然家长为孩子选择食材一般比较精细，但是对于肉、鱼这类食材，65度左右的温度还是不能令人满意。

不适合宝宝食物的烹调。另外一个问题在于，儿童尤其是婴儿的消化能力还没有发育完全，因此食物烹调加工的另外一个重要目的——将食材改造的更容易消化吸收就很重要了，尤其是对于中国人这样不擅长生食的高级民族而言。在给孩子添加辅食的时候，有一条原则家长比较熟悉，就是熟比生好。烹调熟的食物因为更软，所以更容易咀嚼消化。除了形态外，在加工过程中，食材本身也会转变，我们很熟悉的就是生鸡蛋煮熟之后蛋白质变性，更利于被孩子吸收。蛋白质变性的温度一般是60-80度，因此用“焖烧杯”煮出来的蛋，基本上是软黄的，但是对年龄较低的宝宝来说则是负分的。

维生素损失较多。焖烧杯做的粥口感差些，但重要的是焖的时间长了，B族维生素损失较多，大米泡的时间越长，损失维生素越多。比如，小米中含的B族维生素比较多，比大米营养成分要丰富，加上小米不像大米柔软，需要浸泡的时间更长，所以维生素损失更多。有许多人喜欢用开水冲鸡蛋喝，但营养专家不建议这样做，因为突然一下降低温度，好多鸡蛋皮上的沙门氏菌都杀不死，最好还是蒸鸡蛋羹或者是煮鸡蛋。