硫代硫酸根离子具有中等强度的还原性或较强的络合（配位）能力。硫代硫酸根离子是硫酸根中的一个非羟基氧原子被硫原子所替代的产物，因此硫代硫酸根离子的构型与硫酸根离子相似，为四面体型。硫代硫酸根酸离子在碱性条件下很稳定，有很强的络合能力。

硫代硫酸根呈阳性，酸性环境下易被还原。所以酸性条件下硫代硫酸根不能稳定存在，而跟能引起双水解的物质也不能稳定共存，与大部分中性离子在碱性条件下能共存，由于其水解性，其盐溶液一般呈碱性。