肽酶是一种能够水解肽链的酶，是国际生物化学和分子生物学联盟命名委员会推荐的作为所有蛋白水解酶的一般术语，可以分为两大类型，即内肽酶和外肽酶。其中内肽酶作用于多肽链内部的特定肽键，外肽酶作用于多肽底物的N杠末端或C杠末端，催化游离氨基酸和小肽的生成。