1、换水，对于水面较小，水源稳定塘口，定期换水是一种行之有效的处理方法，在经济上可行，操作管理也方便；

2、投加化学药剂，当已经发生富营养化蓝藻暴发引起水体变臭时，可以采用局部用药的方法直接向蓝藻投加化学药剂，从而消除藻类，一般沿池边泼洒含氯杀藻剂，或硫酸铜、络合铜等重金属盐，此法有一定效果；

3、控制水体富营养化，采用生物及化学方法，有效降低水体富营养化程度，以达到间接抑制蓝藻的繁殖，通常每10天左右，全池泼洒1次枯草芽孢杆菌及腐植酸钠，同时杜绝生活污水进入池塘，以消除有机磷对水体的影响；

4、生物生态修复法，生态法就是以生态学原理为指导，将生态系统结构与功能应用于水质净化。