三星堆文明因为鱼凫国灭而就此消失的。2001年,在成都西郊,考古工作人员发现了金沙遗址,出土了1000余件文物,其中有30余件金器。这些金器的铸造风格与三星堆出上的青铜面具基本一致,金带上的符号与三星堆出士的金杖上的符号一致,青铜人像的造型风格也与三星堆青铜人像一致。而据测定,金沙遗址距今约3000年,这一时期正好相当于三星堆文明的末期。杜宇迁都郫邑,金沙遗址距今天的哪县不过二三十千米,历史上属于郫邑的范围。由此推断,金沙遗址文化与三星堆文化有着密切的联系。

有考古学家据此推断,金沙遗址就是杜宇迁至郫邑的都城,不过此结论尚缺乏更多证据的支撑。

还有人认为,可能是一场可怕的洪水毁灭了三星堆文明。这部分人给出的理由是从三星堆古城遗址判断,古城北临鸭子河,而马牧河从城中穿过,这符合古蜀先民择水而居的习惯,但是也埋下了巨大的隐患。可能是3000年前的场酒天洪水毁灭了三星堆文化。