甲基叔丁基醚有很强的抗自动氧化性，不易生成过氧化物，主要供炼油厂作高辛烷值汽油的调合剂，也可作石蜡、油品、香料、生物碱、树脂、橡胶的溶剂、有机合成反应剂。在作为汽油的辛烷值改进剂时，除可增加汽油含氧量外，还可促进清洁燃烧，减少汽车有害物排放污染。甲基叔丁基醚还用于甲基丙烯醛和甲基丙烯酸的生产。